多數的寶石都是由礦物所琢磨而成，那麼寶石礦物的組成原子就跟礦物一樣有一定的排列方式，也就是所謂的「結晶構造」；一般可區分為六種基本型式，稱為六大晶系（詳見礦物晶系單元）。
　　1.等軸晶系（Isometric System）－三晶軸等長且互相垂直。鑽石、石榴子石、尖晶石、青金岩等代表之。
　　2.正方晶系（Tetragonal System）－三晶軸彼此互相垂直，其中兩水平晶軸等長，但與另一垂直晶軸不等長。代表者有鋯石、金紅石等。
　　3.六方晶系（Hexagonal System）－具有四晶軸，其中三個水平晶軸等長，且彼此以60°角斜交；另一垂直晶軸與水平晶軸成直角相交，但不等長。剛玉、綠柱石家族、石英家族、電氣石等均為典型代表。
　　4.斜方晶系（Orthorhombic System）－具有不等長的三晶軸，但晶軸彼此互相垂直。橄欖石、金綠寶石、托帕石、矽線石、丹泉石、堇青石等屬之。
　　5.單斜晶系（Monoclinic System）－具有不等長的三晶軸，其中ｂ軸與其他二軸皆成垂直正交，而ａ軸與ｃ軸則斜交，不等於90°。代表寶石種類有正長石、鋰輝石、透輝石、翡翠、軟玉等。
　　6.三斜晶系（Triclinic System）－具有不等長的三晶軸，彼此間相交且互成斜角。綠松石、藍晶石、鈉長石等屬於此類。