關於金門島的誕生，可以追溯自三疊紀晚期以來，南嶺褶皺帶經歷了印支運動、燕山運動、喜馬拉雅運動等一系列的大地構造運動，而在此褶皺帶東緣，所形成的一個斷塊隆起的島嶼─金門就誕生了。
　　就地質背景而言，在距今2億到1億年前的燕山運動期中，福建東南斷裂活動十分強烈，同時也有廣泛的岩漿活動，影響所及產生了數條深斷裂帶，這些斷裂帶控制了火山噴發和岩漿侵入形成潛伏的巨大花崗岩岩體。金門位於長樂─南澳深斷裂帶的右側，在閩東變質岩帶中段，其構成基盤的花崗岩類岩石正是燕山構造運動中、晚期的產物。金門與鄰近的福建沿海地區，為同一地質構造與火成岩區，具有相近的岩石組成，主要為片麻岩、角閃岩、混合岩及花崗岩。