生物體具有硬質部份，當然是形成化石的必要條件，不過在特殊埋藏環境中，不具有硬骨骼的生物甚至是生物體的軟組織 也都有保留下來的記錄，加拿大的『伯吉斯頁岩（Burgess Shale）』與中國的『澄江生物群（Chengjiang Fauna）』就是其中相當著名的二個例證。一般，有利於化石保存的埋藏條件，包括快速掩埋、隔絕空氣（如：樹脂、瀝青）、缺氧、低溫、 乾燥、高鹽度、長久掩埋，以及早期成岩作用等。