蚓螈的六個科其辨別方式是藉由一些特徵上的組合包含生殖生物學、身體的外部型態、骨骼、牙齒及肌肉。在分子生物上的資料正陸續增加當中，未來可幫助在親緣關係上的了解以及解決蚓螈類群辨識上的問題。我們對這些兩生類動物了解的程度少到連牠們的科與屬都沒有俗名，甚至連大部分的種也是。
　　吻蚓科（Rhinatrematidae）和魚螈科（Ichthyophiidae）所包含的屬在每一個體節上有好幾個環（不是只有一或兩個環）、尾部的脊柱（一條「尾巴」）延伸到肛門的另一邊、顱骨的數量較多以及在生殖上具有獨立生存幼體的產卵模式。盲尾蚓科（Uraeotyphlidae）也擁有這些特徵中的大多數，但具有數量較少的顱骨、不同的肌肉系統以及在大部分的體節上有兩個環。真蚓科（Caeciliidae）在每個體節上只有一或兩個環、沒有真正的尾巴且具有數量較少的顱骨。有些骨頭似乎從未發育，而有些則是融合成較少數量。牠們有可能是卵生（具有幼體或是直接發育的幼體）也可能是胎生。胎生的盲游蚓科（Typhlonectidae）每個體節上有一個環以及小到中型的背「鰭」。牠們是水生的或半水生的，在蚓螈當中是唯一非陸生掘洞者。蠕蚓科（Scolecomorphidae）的每個節上也是只有一個環，牠們有好幾個種是屬於胎生但顱骨則是少了鐙骨或是中耳骨。