蚓螈在許多曾被觀察到的地區變得越來越稀少，由於土地利用的改變（特別是為了農業及牧場經營而進行的森林破壞）是引起許多族群或某些物種整體數量受到限制甚至滅絕的原因。而壺菌的感染已經在某些青蛙及蠑螈的物種中被發現，同樣也在一些地區造成蚓螈的死亡。這種感染似乎是整個環境惡化的預兆，因而波及了遭受壓力及脆弱的動物。不幸的是，就在科學家開始重視蚓螈的生物學及其在生態系統中的地位之時，蚓螈正在逐漸死亡，並且甚至可能面臨到滅絕的命運。