藝閣是北港媽祖遶境的另一特色，從三月19日到23日。相傳於清朝年間由祖居泉廈的先民引入，至今有數百年歷史。最早是由人力扛抬，現在多以大拖車承載。日治時期的藝旦，坐在閣台上面抱著琵琶自彈自唱，演奏南管曲調，稱為「裝台閣」（呂雲騰1999：78），民間俗稱為「藝旦閣」（陳瑜詩2007：177）。藝旦閣消失後，藝閣多由孩童身著古裝，扮演戲劇角色，閣台裝飾也日趨高雅，因此又稱為「詩意閣」（蔡佩青2006：52）。這一風俗在北港延續至今，仍以孩童為主，是全台少數非電動人偶演出的藝陣。北港的藝閣除了朝天宮支持，當地的鋪會（各同業公會）以及各鄰里的贊助也是重要力量，每年舉辦比賽，三月23日公布結果頒獎，也讓活動圓滿結束。