數位典藏是將珍貴典藏文物，藉由數位科技加以數位化保存管理，本館數位典藏計畫在動物、植物、地質、人類、藻類及菌類等六大學域三十四學門專業人員共同努力下，結合數位與通訊科技將本館重要、具代表性、具獨特性及具教育與經濟價值典藏菁華，建構跨領域典藏知識庫、典藏標本庫、多媒體資源庫與學習資源庫等獨特且多元之自然與人文研究及教育資源，分享社會大眾、教育界及學術界使用，並授權產業界開發文化創意商品。