短肢領航鯨雖特徵顯著，但還是很難與其近親－長肢領航鯨區分。不過這兩者間依然存在著微妙的差異：主要在其胸鰭的長度、牙齒的數目，以及頭顱的形狀。而且短肢領航鯨大都喜棲息在溫暖的水域，因而分佈範圍重疊不多。別名：圓頭鯨、太平洋領航鯨。