瓣葉珊瑚科是基於對現生石珊瑚類分子親緣關係的研究結果（如：Fukami et al., 2008）所建立，包含原先歸屬於苔珊瑚科Mussidae的棘星珊瑚（Acanthastrea、澳洲苔珊瑚（Australomussa、擬薊珊瑚（Cynarina）、瓣葉珊瑚（Lobophyllia）、薊珊瑚（Scolymia）、合葉珊瑚（Symphyllia）、小苔珊瑚（Micromussa）等七個屬，以及梳珊瑚科Pectiniidae中的棘葉珊瑚（Echinophyllia）與銳孔珊瑚（Oxypora）等兩個屬，總計九個屬的珊瑚納入而成；以瓣葉珊瑚屬為瓣葉珊瑚科的模式屬。本科珊瑚有個體型與群體型類別，群體型的外形為團塊狀或葉片狀。目前已知瓣葉珊瑚科的最早化石紀錄為新生代第三紀漸新世。