菊珊瑚類廣泛分布於印度－太平洋海域各種珊瑚礁環境中，也是石珊瑚目中「屬」數目最多的一科，物種數目則僅次於軸孔珊瑚科Acroporidae，是新生代珊瑚礁相當重要的造礁生物類別。澳洲學者Veron et al.（1977）曾對現生菊珊瑚科15屬62種做廣泛而詳細的分類描述與討論，之後又在Veron & Stafford-Smith（2000）的『Corals of the World』一書第三冊中，廣納現生菊珊瑚科計24屬126種，並逐一簡述種屬特徵、生境（habitat）、地理分布，以及與相似種之間的比較；這些全面性有關菊珊瑚科分類的回顧，便廣為珊瑚分類學家所採用；但根據近年分子親緣關係的研究結果（Fukami et al., 2008），卻顯示前述傳統分類系統中菊珊瑚科的各個屬為多重起源，例如：原歸屬菊珊瑚科的黑星珊瑚（Oulastrea）、柔星珊瑚（Leptastrea）與蕈珊瑚科Fungiidae有較近的親緣關係，枝幹珊瑚（Cladocora）、孔星珊瑚（Solenastrea）與目珊瑚科Oculinidae親緣較近，以及圓星珊瑚（Plesiastrea）、雙星珊瑚（Diploastrea）、擬單星珊瑚（Parasimplastrea）等均與菊珊瑚類的大多數種屬親緣關係疏遠，都應移出菊珊瑚科；而繩紋珊瑚科Merulinidae中的繩紋珊瑚（Merulina）、碓珊瑚（Hydnophora）、紋柱珊瑚（Scapophyllia），與梳珊瑚科Pectiniidae中的梳珊瑚（Pectinia）、斜花珊瑚（Mycedium），以及粗葉珊瑚科Trachyphyliidae中的粗葉珊瑚（Trachyphylia）應可歸入菊珊瑚科中；還有些菊珊瑚類種屬的親緣關係仍有待更多的研究。此外，分子生物的研究結果也指出，菊珊瑚科的模式種Favia fragum (Esper, 1795)與苔珊瑚科Mussidae親緣關係較近；因此，有學者（Dai & Horng, 2009）就建議另行指定正菊珊瑚Favia favus (Forskål, 1775)為菊珊瑚科的模式種，以保留「菊珊瑚科」這個具有悠久歷史並廣為使用的科名。
　　　菊珊瑚科有個體型與群體型類別，群體發育方式為觸手環內與觸手環外出芽；群體的外形為枝狀、叢狀、柱狀、團塊狀、葉片狀、板葉狀或表覆生長皮殼狀等。珊瑚孔的外形與排列也相當多樣化，有盤形（plocoid）、柵形（phaceloid）、細胞形（ceroid）、紋形（meandroid），以及波紋形板葉狀（flabello-meandroid）等；珊瑚孔壁則大多為隔片外端沿羽榍發散軸增厚而成的隔片壁（septotheca），或者是由鱗板所形成的鱗板壁（paratheca；或稱擬壁），極少數種類的部分孔壁是由隔片聯桿（synapticulae）所形成的聯桿壁（synapticulotheca）；珊瑚的隔片突出（exerted）、片狀，為簡單羽榍的單一或二個羽扇（1 or 2 fan system of simple trabeculae）發育而成，隔片上緣的隔片齒發育程度不等，籬片（paliform lobes）為隔片內端的羽扇系所衍生；中柱為羽榍中柱（trabecular columella；＝腔壁中柱parietal columella＝海綿狀中柱 spongy columella）、片狀，或者不發育。最早化石紀錄為中生代侏儸紀。