短肢領航鯨生活在熱帶與亞熱帶附近的溫暖水域中，在太平洋裡，牠們的分布範圍北從日本與加州中部，南至澳洲東北方。牠的特徵是有著圓球型的頭部、結實且修長的身體、背鰭末端略呈圓形，與長肢領航鯨相當類似，其最大的差異在於胸鰭和體長的比例，短肢領航鯨的胸鰭約為體長的14-19﹪，較長肢領航鯨為短，但其並不容易分辨。
　　古生物學家是由牙齒的數目與頭骨的構造特徵來作為化石鑑定的依據，大致來說它的上下頜各有著七到九對的牙齒。而在台灣，漁民曾經在台灣海峽澎湖海溝附近的海域，撈獲短肢領航鯨化石的紀錄。