一個曾經被破壞的遺址，不但失去文化層的脈絡，連帶著文化期的器具也殘破不勘；牛埔遺址在1992年被發現後，雖陸續有考古人員前往調查或試掘，但未正式發掘就於2008年遭受大規模的破壞，本館據報後，只能做事後的搶救工作。

牛埔遺址發掘與地表採集大約獲得1千4百多片陶器標本，數量雖多，但都是殘件，難以復原為完整器形；不過可以依陶器的質地、顏色、器形等特性來判斷其文化類型，大致可分為牛罵頭文化、營埔文化與番仔園文化陶器。

其中以牛罵頭文化陶器占最多數，其次為營埔文化陶器，番仔園文化偶有發現，但沒有發現文化層，前二文化期均發現文化層，因此判定牛埔遺址包含牛罵頭文與營埔文化雙文化層。