生物的命名須有一定的規範，使所有人得以共同遵循，以避免分類學的混亂。真菌雖不是植物，但其命名則受『國際植物命名規約』 (International Code of Botanical Nomenclature, 簡稱ICBN) 的規範。

在 ICBN 的原則中規定『分類群名稱的使用須依命名模式決定之』，因此命名模式即成為某一分類群之構成要素。比方說一個分類科名必基於其模式屬而成立，一個屬名也必須有其模式種以為根據。

同樣的，一個種的成立必須有模式標本的指定，日後當有對於標本種類鑑定之爭議時，才有比對的依據。模式標本的指定主要做為種類認定的依據，不必然是該種生物最『典型』的標本。對於真菌模式標本之認定有爭議時，均應依 ICBN 的條款解釋。

模式標本主要可分下述幾類：

1. 正模式 (Holotype)：新種發表時所指定的一號模式標本。
2. 同模式 (Isotype)：由正模式標本所分出的部分標本，具有與正模式同樣的識別特徵。同模式的產生主要在避免正模式標本遺失或損壞時所致之風險。
3. 合模式 (Syntype)：新種發表時並未指定一號標本為正模式，卻引用了兩個或更多的標本，則這些標本共同稱為合模式標本。
4. 選模式 (Lectotype)：新種發表時作者未指定正模式標本時，日後須選定合模式標本之一號做為該種之模式，如此所選定者稱選模式標本。
5. 新模式 (Neotype)：新種發表所依據的所有標本均遺失或毀壞無法使用時，須另外指示足以代表該種特徵的標本做為模式，稱新模式標本。
6. 副模式 (Paratype)：新種發表時，正模式及同模式以外之該種引用標本，稱副模式標本。因此未指定正模式時，亦無副模式。當正模式及同模式標本等均不存在時，須自副模式標本中擇定出選模式標本。