最早由顏滄波（Yen, 1987）所提出，代表澎湖群島以玄武岩為主，而以沈積岩或火山凝灰角礫岩局部出現的地層。
標準地層以西嶼南端之外垵漁港海岸附近所出露的岩層為代表。
澎湖層的岩性包括玄武岩、沈積岩和火山凝灰角礫岩。玄武岩相佔澎湖層的絕大多數，是由數層玄武岩熔岩流疊置而成。